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實時熒光定量PCR檢測步驟和注意事項【附視頻教程】

2021-04-26 21:06:57

來源/作者:普拉特澤生物-醫(yī)學整體課題外包

一、實時熒光定量PCR的概念

什么是QPCR實時熒光定量PCR檢測技術是指在PCR反應體系中加入可與DNA產(chǎn)物異形結(jié)合的熒光基團,利用熒光信號積累監(jiān)測整個PCR過程,最終通過相對定量和絕對定量的方法確定各個樣本的表達量。


二、QPCR實驗的應用及分類

關于QPCR絕對定量和相對定量的應用,絕對定量技術通常在病原體檢測、轉(zhuǎn)基因食品檢測以及基因表達研究中應用比較廣泛;相對定量應用于mRNA表達量分析、siRNA干擾效果的驗證和基因過表達以及基因芯片效果的驗證。


三、QPCR技術的兩大分類優(yōu)缺點對比

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四、實時熒光定量PCR的實驗步驟:

1、樣本制備;

2、RNA提取;

3、反轉(zhuǎn)錄;

4、QPCR引物設計及預實驗;

5、實時熒光定量QPCR數(shù)據(jù)分析。

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五、QPCR實驗技術有哪些注意事項

1、擴增曲線和熔解曲線

  對于QPCR實驗中涉及到的擴增曲線和熔解曲線需要做如下的要求,由于擴增曲線是反映PCR循環(huán)數(shù)與熒光強度的一條曲線,所以這條曲線要平滑完整,而熔解曲線是將溫度與熒光強度的變化求導得到是對數(shù)圖譜,所以要求熔解曲線是單一峰;

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2、Ct

同樣是QPCR實驗中需要注意的重要參數(shù),它是PCR擴增過程中,擴增產(chǎn)物的熒光信號達到設定閾值時所經(jīng)過的擴增循環(huán)次數(shù),也就是說,我們達到一個平臺期的時候,Ct值的起始value與平臺期之間存在一個Ct循環(huán)數(shù)的差異,我們稱之為該基因的擴增倍數(shù)。經(jīng)過了多少個循環(huán)數(shù)達到平臺期所求出來的差值就是我們的Ct值。其特點是DNA模板量越多,達到熒光閾值的循環(huán)數(shù)越少,所以Ct值越小。

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  如圖所示,它的Ct value越偏向于右邊,它的起始模板量越少,越偏向于左邊,起始模板量越高。而它們最終都是要達到一個平臺期的。

3、反應體系配置

  配置體系時需要注意以下幾點:

  ①SYBR MasterMix不要反復凍融;

  ②在一個管中配置Mix,減少加樣誤差;

  ③所有成分加完后,離心去除氣泡;

  ④每個樣品至3-4個平行孔,方便進行統(tǒng)計學分析;

  ⑤需設置NTC陰性對照組,驗證實驗材料是否具有污染。

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