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核質(zhì)分離檢測不同組分的基因表達(dá)

考馬斯亮藍(lán)有G250和R250兩種。其中考馬斯亮藍(lán)G250由于與蛋白質(zhì)的結(jié)合反應(yīng)十分迅速,常用來作為蛋白質(zhì)含量的測定??捡R斯亮藍(lán)R250與蛋白質(zhì)反應(yīng)雖然比較緩慢,但是可以被洗脫下去,所以可以用來對病理組織內(nèi)的蛋白質(zhì)進(jìn)行染色。通過PARISTM Kit Protein and RNA Isolationg System 核質(zhì)分離試劑盒將細(xì)胞的胞核與胞質(zhì)分開,提取這兩部分的RNA,進(jìn)行QP檢測。檢測胞質(zhì)與胞核中目的基因及內(nèi)參基因的表達(dá)在細(xì)胞總表達(dá)的占比。

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實驗介紹

實驗原理

通過PARISTM Kit Protein and RNA Isolationg System 核質(zhì)分離試劑盒將細(xì)胞的胞核與胞質(zhì)分開,提取這兩部分的RNA,進(jìn)行QP檢測。檢測胞質(zhì)與胞核中目的基因及內(nèi)參基因的表達(dá)在細(xì)胞總表達(dá)的占比。

實驗方法

Step1: 細(xì)胞收集之后,預(yù)冷的PBS清洗一遍,3000g離心5min后取上清,置于冰上。加入合適體積預(yù)冷的Cell Fractionation Bufeer 重懸細(xì)胞,輕輕打勻。冰上孵育10min。

Step2: 孵育10分鐘后,500g,4℃離心5min,分離胞漿和胞核。上清轉(zhuǎn)移至新的無RNA酶的EP管中,置于冰上,此為胞漿。

Step3: 胞核沉淀加入預(yù)冷的Cell Fractionation Bufeer 重懸,吹打混勻后500g,4℃離心1min,去上清。胞核沉淀中加入預(yù)冷的Cell Disruption Buffer ,冰上裂解至溶液均一。(裂解至溶液透明)

Step4: 胞漿和胞核中分別加入等體積的2X Lysis/Binding Solution,上下顛倒混勻,室溫裂解。

Step5: 加入與裂解液相同體積的無水乙醇,混合均勻。

Step6: 將混合液分別置于濾柱中過濾,10000g,室溫離心1min,丟EP管,轉(zhuǎn)移濾柱至試劑盒提供的EP管中進(jìn)行清洗。

Step7: 加入700ulWash SolutionⅠ10000g,室溫離心1min。倒掉液體,濾柱中加入500ulWash Solution2/3,10000g,室溫離心,10000g,室溫離心1min

Step8:倒掉廢液,空管離心一次,10000g,室溫離心1min,更換EP管。

Step9:DEPC水加熱到95-100℃加35ul至濾柱中央,10000g室溫離心30s。丟棄濾柱,分別得到胞漿和胞核的RNA。


案例展示

123.png1234.png

左:擴(kuò)增曲線; 右:溶解曲線

通過監(jiān)測不同循環(huán)階段的熒光強(qiáng)度,直至曲線平滑達(dá)到細(xì)胞中該基因的表達(dá)高峰。Ct值越低,表達(dá)越高。


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 通過2-meanCt公式計算基因在胞核與胞質(zhì)的表達(dá)大小,繪制柱狀圖,得到基因在胞核與胞質(zhì)中的表達(dá)占比。

 


技術(shù)總結(jié)

注意事項:

1. 2X Lysis/Binding Solution可能在4°C下凝固。使用前,將溶液加熱至37°C,偶爾攪拌5-10分鐘,或直至完全溶解。

2. 洗脫水需要在95-100℃水浴鍋中預(yù)熱,更好的洗脫柱膜上的RNA,不過由于洗脫溫度過高可能會導(dǎo)致RNA有些許降解。

 

交付標(biāo)準(zhǔn)

1. 實驗報告 

2. 真實實驗結(jié)果

3. 原始圖片

4. 實驗原始數(shù)據(jù)

5. 剩余物料在周期內(nèi)可返還(超過周期,不予返還)


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